Fiziologiki şertleri meňzeş etmek gözlegçilere metal baglaýjylary tapmaga kömek edýär
Gözlegçiler metal ionlaryny birleşdirýän ownuk molekulalary kesgitlemegiň usulyny oýlap tapdylar. Metal ionlary biologiýada möhümdir. Emma haýsy molekulalaryň, esasanam haýsy ownuk molekulalaryň - şol metal ionlarynyň täsir edýändigini kesgitlemek kyn bolup biler.
Derňew üçin metabolitleri aýyrmak üçin adaty metabolomika usullary organiki erginleri we pes pH-leri ulanýar, bu bolsa metal toplumlaryň bölünmegine sebäp bolup biler. Kaliforniýa San-Diýego uniwersitetinden Piter C. Dorrestein we işdeşleri öýjüklerde tapylan ýerli şertleri deňeşdirip, toplumlary derňemek üçin bilelikde saklamak islediler. Emma molekulalary bölmek wagtynda fiziologiki şertleri ulanan bolsalar, synamak isleýän her fiziologiki ýagdaýy üçin aýralyk şertlerini täzeden ulanmaly bolardylar.
Muňa derek, gözlegçiler adaty hromatografiki bölünişik bilen köpçülikleýin spektrometrik derňewiň arasynda fiziologiki şertleri girizýän iki basgançakly çemeleşmäni işläp düzdüler (Nat. Himiýa 2021, DOI: 10.1038 / s41557-021-00803-1). Ilki bilen adaty ýokary öndürijilikli suwuk hromatografiýa ulanyp, biologiki ekstrakt aýyrdylar. Soňra hromatografiki sütünden çykýan akymyň pH-ni fiziologiki şertlere meňzeş edip sazladylar, metal ionlaryny goşdular we garyndyny köpçülik spektrometri bilen analiz etdiler. Derňewi metallar bilen we ownuk molekulalaryň köpçülikleýin spektrini almak üçin iki gezek geçirdiler. Haýsy molekulalaryň metallary baglanyşdyrýandygyny kesgitlemek üçin, baglanyşyk we çäklendirilmedik görnüşleriň spektrleriniň arasyndaky baglanyşyklary kesgitlemek üçin iň ýokary şekilleri ulanýan hasaplama usuly ulanyldy.
Dorrestein, fiziologiki şertleri has takyklaşdyrmagyň bir usuly, natriý ýa-da kaliý ýaly ionlaryň ýokary konsentrasiýasyny we gyzyklanýan metalyň pes konsentrasiýalaryny goşmak bolar diýýär. “Bu bäsdeşlik synagyna öwrülýär. Esasan size habar berer, bu şertdäki bu molekulanyň natriý we kaliý ýa-da goşan ýeke-täk metal bilen baglanyşygy has köp "- Dorrestein. "Bir wagtyň özünde köp dürli metal guýup bileris we bu kontekstdäki ileri tutma we saýlama düşünip bileris".
Escherichia coli-den medeni ekstraktlarda gözlegçiler ersersiniabactin we aerobactin ýaly belli demir baglaýjy birleşmeleri kesgitlediler. Ersersiniabactin ýagdaýynda, sinkiň hem baglanyp biljekdigine göz ýetirdiler.
Gözlegçiler, nusgalarda metal baglaýjy birleşmeleri okeandan erän organiki maddalar ýaly çylşyrymly diýip kesgitlediler. Dorrestein: "Bu, meniň gören iň çylşyrymly nusgalarymyň biri. "Bu, çig nebitden has çylşyrymly bolsa gerek." Bu usul domoik kislotany mis bilen baglanyşdyrýan molekula hökmünde kesgitledi we Cu2 + -ni dimer hökmünde baglanyşdyrmagy teklip etdi.
Demirgazyk Karolina Döwlet Uniwersitetinde ösümlikler we mikroblar tarapyndan öndürilen metal baglaýjy metabolitleri öwrenýän Oliwer Baars: "Bir nusgadaky ähli metal baglaýjy metabolitleri kesgitlemek üçin omics çemeleşmesi, örän peýdalydyr" -diýdi. e-poçta iberiň.
Utrext uniwersitetiniň ýerli köpçülikleýin spektrometriýa seljermesiniň öňdebaryjysy Albert JR Hek e-poçta hatynda: "Dorrestein we işdeşleri metal ionlarynyň öýjükdäki fiziologiki rolunyň nämedigini has gowy barlamak üçin ajaýyp, gaty zerur bir analiz berýär" -diýdi. "Indiki ädim, öýjüklerden ýerli şertlerde metabolitleri çykarmak we olary ýerli şertlerde bölmek, haýsy metabolitleriň haýsy endogen öýjükli metal ionlaryny göterýändigini görmek bolar."
Himiýa we in Engineeringenerçilik habarlary
ISSN 0009-2347
Awtorlyk hukugy © 2021 Amerikan himiýa jemgyýeti
Iş wagty: 23-2021-nji dekabry